دائرة الميناء والجمارك هي دائرة حكومية تابعة لحكومة عجمان تم إعادة تنظيمها بالمرسوم الأميري رقم (15) لعام 2011م الصادر بتاريخ 6 ديسمبر 2011م. وتعنى دائرة الميناء والجمارك عجمان بتنظيم قطاع النقل البحري في إمارة عجمان، وتطبيق قانون الجمارك الموحد لدول مجلس التعاون الخليجي لعام 2002م ولائحته التنفيذية، والقواعد والنظم والأحكام التشريعية المحلية النافذة فيما يتعلق بالشؤون الجمركية والبحرية.